Prodi Sanitasi Program Diploma Tiga Kampus Magetan merupakan salah satu jenjang pendidikan Tinggi Milik Kementrian Kesehatan Repubelik Indonesia yang pada mulanya merupakan pengembangan dari Sekolah Pembantu Penilik Hygiene ( SPPH ) Madiun yang berdiri pada tahun 1983 dan berdasarkan Surat Keputusan Menteri Kesehatan Republik Indonesia No. HK.00.06.1.1.2258 Tanggal 07 Juli 1995 tentang penunjukan Akademi Kesehatan Lingkungan Departemen Kesehatan Madiun Propinsi Jawa Timur, untuk menyelenggarakan program pendidikan D III Bidang Kesehatan Lingkungan, maka SPPH Madiun mulai Tahun Akademik 1995/1996 Menyelenggarakan Program Pendidikan Diploma III Kesehatan Lingkungan / AKL. Berdasarkan Surat Keputusan Menteri Kesehatan Republik Indonesia No. HK. 00.06.1.3 . 2995 Tanggal 24 Juni 1998 Tentang penunjukan Akademi Kesehatan Lingkungan Madiun di Magetan untuk menyelenggarakan Program Diploma III Khusus Kesehatan Lingkungan bagi Lulusan SPPH. Pada Tahun Akademik 1999 / 2000 merupakan angkatan pertama. Kemudian pada tahun 2001 Departemen Kesehatan RI melalui Pusdiknakes mengembangkan kelembagaan institusi Akademi Kesehatan menjadi Politeknik Kesehatan (Poltekkes). Termasuk 13 Akademi Kesehatan yang ada di Jawa Timur melembaga menjadi Poltekkes Surabaya sesuai dengan SK Menkes-Kesos No.1207/Menkes-Kesos/SK/X/2001 tanggal 12 Nopember 2001. Institusi tersebut salah satunya adalah Program Studi Kesehatan Lingkungan Kampus Magetan.
Berkenaan telah diterbitkannya Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan Nomor 364 / M / 2O2O tentang Perubahan Nama Program Studi pada Politeknik Kesehatan Kementerian Kesehatan Surabaya di Kota Surabaya yang Diselenggarakan oleh Kementerian Kesehatan. Berdasarkan surat Kepala Pusat Pendidikan Sumber Daya Manusia Kesehatan Kementerian Kesehatan Nomor DP.01.01 / 1 / 07059 / 2019 tanggal 15 Oktober 2019, perlu menetapkan Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan tentang Perubahan Nama Program Studi pada Politeknik Kesehatan Kementerian Kesehatan Surabaya di Kota Surabaya Menetapkan Program Studi Kesehatan Lingkungan Kampus magetan menjadi :
Program studi D3 Kesehatan Lingkungan Kampus Magetan merupakan salah satu Perguruan Tinggi Negeri yang berlokasi di Magetan dan berada di bawah naungan Kementerian Kesehatan RI
Program Studi D3 Kesehatan Lingkungan Kampus Magetan memberikan kesempatan bagi para lulusan SMA/MA/SMK sederajat. Diploma III Kesehatan Lingkungan yang ingin mengembangkan diri dalam mengatasi masalah sanitasi Kesehatan Lingkungan di Masyarakat dan di Industri
“Program Studi Kesehatan Lingkungan Kampus Magetan sebagai rujukan pendidikan tinggi bidang Kesehatan Lingkungan yang unggul berbasis pemberdayaan masyarakat di bidang sanitasi Tahun 2020.”